Клиническая генетика : учебник / Н. П. Бочков, В. П. Пузырев, С. А. Смирнихина ; под ред. Н. П. Бочкова. - 4-е изд., доп. и перераб. - 2011. - 592 с. : ил.
|
|
ПРИЛОЖЕНИЕ
ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ТЕРМИНЫ
Аберрация хромосомная (или хромосомная аномалия) - обобщенное название любого из типов хромосомных мутаций: делеций, транслокаций, инверсий, дупликаций. Иногда обозначают и геномные мутации (анеуплоидии, трисомии и т.д.).
Аллель - одна из двух или более альтернативных форм гена, каждая из которых характеризуется уникальной последовательностью нуклеотидов.
Аллель молчащий - мутантный ген, не имеющий обнаруживаемых фенотипических признаков.
Аллельная гетерогенность - наличие в рамках единой нозологической формы различных вариантов заболевания, обусловленных различными мутантными аллелями одного гена.
Аллельные заболевания - фенотипически различные заболевания, обусловленные разными мутациями в одном и том же локусе (гене).
Аллель-специфический олигонуклеотид - олигонуклеотидный зонд, синтезированный в полном соответствии с конкретной последовательностью ДНК. Дает возможность распознавать аллели, отличающиеся одним или несколькими основаниями.
Альфа-фетопротеин (α-фетопротеин - АФП) - эмбриональный белок, обнаруживаемый в крови плода, новорожденного, беременной, а также в амниотической жидкости.
Амниоцентез - прокол амниотического мешка с целью получения амниотической жидкости, содержащей клетки плода.
Амплификация - увеличение числа копий определенного фрагмента ДНК.
Анализ сегрегации - статистический метод оценки распределения индивидов по фенотипу для определения наиболее вероятного типа наследования болезни или признака.
Анеуплоидия - измененный набор хромосом, в котором одна или несколько хромосом из обычного набора или отсутствуют, или представлены дополнительными копиями.
Антикодон - три основания тРНК, комплементарные кодону в мРНК.
Антимутагенез - процесс предотвращения закрепления (становления) мутации, т.е. возврат первично поврежденной хромосомы или гена в исходное состояние.
Антиципация - более раннее появление и более тяжелое течение заболевания в каждом последующем поколении.
Ассортативные браки - браки, при которых выбор брачного партнера по одному или нескольким признакам неслучаен.
Ассоциация - 1) в генетической эпидемиологии: явление, при котором частота встречаемости конкретного аллеля значительно больше или меньше в группе больных по отношению к частоте в популяции, к которой относится группа больных; 2) в дисморфологии: сочетание аномалий неизвестной этиологии и патогенеза, встречающихся совместно чаще, чем при случайном сочетании.
Аутосома - любая неполовая хромосома. У человека имеется 22 пары аутосом.
Аутосомно-доминантное наследование - тип наследования, при котором одного мутантного аллеля, локализованного в аутосоме, достаточно для проявления болезни или признака.
Аутосомно-рецессивное наследование - тип наследования признака или болезни, при котором мутантный аллель, локализованный в аутосоме, должен быть унаследован от обоих родителей.
Бивалент - сцепленная пара гомологичных хромосом, наблюдаемая в метафазе первичного мейотического деления.
Биоинформатика - вычислительный анализ и хранение биологических и экспериментальных данных. Применяется в геномных и протеомных исследованиях.
Биопсия хориона - процедура, осуществляемая на 7-11-й неделе беременности, с целью получения клеток для пренатальной диагностики.
Блот-гибридизация по Саузерну - идентификация участка ДНК, содержащего искомую нуклеотидную последовательность, путем гибридизации разделенных гель-электрофорезом и фиксированных на твердом материксе фрагментов ДНК с меченым комплементарным ДНК-зондом.
Вектор (генетический) - материал, применяемый для переноса в клетку генетической информации. Наиболее часто применяют плазмиды и вирусы (ретровирусы, аденовирусы и др.). Возможно применение синтетических конструкций.
Вектор для клонирования - любая небольшая плазмида, фаг или ДНК-содержащий вирус животных, в которые может быть встроена чужеродная ДНК.
Вестерн-блоттинг - метод, сходный с блот-гибридизацией по Саузерну, используется для детекции белков, обычно иммунологическими методами.
Врожденные болезни - болезни, имеющиеся при рождении, необязательно генетической природы.
Вставка - см. инсерция.
Гамета - зрелая половая клетка.
Гаплоидный - содержащий одинарный набор хромосом.
Гаплонедостаточность - состояние организма, когда вклад нормального аллеля недостаточен для предупреждения болезни в связи с мутацией с утратой функции в другом аллеле.
Гаплотип - комбинация конкретных аллелей на одной хромосоме.
Гемизиготность - состояние организма, при котором какой-то ген представлен в одной из гомологичных хромосом, но отсутствует или инактивирован на другой.
Ген - последовательность нуклеотидов в ДНК, кодирующих определенную мРНК и соответствующий белок, либо РНК, несущие структурные или регуляторные функции.
Ген гомеозисный - консервативная последовательность из 180 пар оснований, названная гомеобоксом в связи с тем, что она кодирует участок, известный как гомеодомен.
Ген-модификатор - ген, изменяющий фенотип, вызванный мутациями в неаллельном гене.
Генетическая ассоциация - математическая корреляция между частотой или характером заболевания и определенным аллелем изучаемого гена.
Генетический маркер - полиморфный участок ДНК строго определенной локализации, разные аллели которого позволяют дифференцировать различные по происхождению хромосомы и анализировать их сегрегацию в родословной.
Генетический риск - вероятность появления определенного наследствен ного заболевания.
Генная инженерия - совокупность приемов, методов и технологий получения рекомбинантных РНК и ДНК, выделения генов из организма (клеток), осуществления манипуляций с генами и введения их в другие организмы.
Генная терапия (генотерапия) - способ лечения путем введения дополнительного генетического материала (ДНК или РНК) в клетки, функции которых (или функцию организма) изменяет данный ген, или путем изменения экспрессии генов.
Генодиагностика (ДНК-диагностика) - совокупность методов по выявлению мутаций, приводящих к наследственной патологии.
Генокопия - клинический синдром, манифестирующий под маской известного наследственного заболевания с установленной генетической природой, но обусловленный мутацией в другом гене (локусе).
Геном - полная последовательность ДНК организма; общая генетическая информация, содержащаяся в клетках организма, или генетический состав клетки. Термин «геном» иногда употребляется для обозначения гаплоидного набора хромосом.
Геномика - область исследования структуры и функций генома.
Генотип: 1) набор генов индивида или вся генетическая информация организма; 2) конкретная пара аллелей, которые индивид имеет в данном участке генома.
Гены служебные («домашнего хозяйства») - экспрессируемые в большинстве или во всех клетках гены; их продукты обеспечивают основные функции клетки.
Гетерогенность генетическая - формирование одинаковых или похожих фенотипов при разных генетических причинах.
Гетерогенность локусная - идентичные фенотипы вследствие мутаций в двух или более разных локусах.
Гетерозигота - клетка (или организм), содержащая два различных аллеля в конкретном локусе гомологичных хромосом.
Гетерозигота двойная - индивид, гетерозиготный по двум разным локусам. Не путать с компаундной гетерозиготой.
Гетерозигота компаундная (компаунд) - индивид с двумя различными мутантными аллелями в одном локусе.
Гетерозиготный организм - организм, имеющий две различные формы данного гена (разные аллели) в гомологичных хромосомах.
Гетероплазмия - наличие в клетках нормальных и мутантных молекул митохондриальной ДНК.
Гетерохроматин - бедная генами область хромосомы (иногда даже целая хромосома), имеющая плотную компактную структуру в интерфазе.
Гибридизация (ренатурация, отжиг) - взаимодействие комплементарных цепей ДНК (или ДНК и РНК), приводящее к образованию двухцепочечной молекулы.
Гибридизация геномная сравнительная (CGH - Comparative Genome Hybridization) - техника флюоресцентной гибридизации, используе-
мая для сравнения двух образцов ДНК относительно содержимого конкретного сегмента или сегментов ДНК.
Гибридизация in situ - гибридизация между денатурированной ДНК клеток на предметном стекле и меченной радионуклидами или флюоресцентными соединениями одноцепочечной РНК или ДНК.
Голандрическое наследование - наследование, сцепленное с Y-хромосомой.
Гомозигота - клетка (или организм), содержащая два одинаковых аллеля в конкретном локусе гомологичных хромосом.
Гомозиготный организм - организм, имеющий две идентичные копии данного гена в гомологичных хромосомах.
Гомологичные хромосомы - хромосомы, одинаковые по набору составляющих их генов.
Гомоплазмия - наличие в клетках одного вида митохондриальной ДНК (нормальной или мутантной).
Груз генетический - итоговая сумма смертей и болезней, вызванных мутантными генами.
Группа сцепления - все гены, локализованные в одной хромосоме.
Дактилоскопия генная - выявление вариаций в числе и длине тандемных повторов ДНК.
Делеция - тип хромосомной мутации, при которой утрачивается участок хромосомы; тип генной мутации, при которой выпадает участок молекулы ДНК.
Денатурация - переход молекулы ДНК из двухцепочечной формы в одноцепочечную вследствие разрыва водородных связей между комплементарными основаниями.
Диплоидный - содержащий двойной набор хромосом.
Дискордантность - ситуация, в которой один член пары имеет определенный качественный признак, а другой нет.
Дисомия однородительская - присутствие в кариотипе двух копий конкретной хромосомы, унаследованных от одного из родителей, без участия другого родителя.
Дицентрик - структурно аномальная хромосома с двумя центромерами.
ДНК-полимераза - фермент, осуществляющий комплементарный синтез (репликацию) ДНК.
Доза гена - количество копий конкретного гена в геноме.
Домен - участок аминокислотной последовательности белка, связанный с определенной функцией.
Доминантный - признак или соответствующий аллель, проявляющийся у гетерозигот.
Доминантный негативный - патологический аллель или эффект такого аллеля, нарушающий функцию аллеля дикого типа в той же клетке.
Дрейф генов - изменение частот генов в ряду поколений, обусловленное случайными событиями митоза, оплодотворения и размножения.
Дупликация - тип хромосомной мутации, при которой удвоен какой-либо участок хромосомы; тип генной мутации, при которой удвоен какой-либо участок ДНК.
Евгеника - научная и практическая деятельность, направленная на повышение распространенности желательных признаков по популяции (положительная евгеника) и снижение частоты патологических аллелей (негативная евгеника) благодаря управляемому, выборочному разведению (стерилизация, насильственные браки).
Заболевание генетическое - болезнь целиком или частично вызванная аномалией генов.
Заболевание моногенное - болезнь, обусловленная одним или парой мутантных аллелей в единственном локусе.
Заболевание хромосомное - болезнь, вызванная аномальной хромосомной или геномной конституцией.
Заболевание экогенетическое - болезнь, вызванная взаимодействием генетической предрасположенности с конкретным фактором окружающей среды.
Закон Харди-Вайнберга - закон, связывающий частоту аллеля с частотой генотипа; используется в популяционной генетике для определения частот аллелей и гетерозигот при известной встречаемости заболевания.
Зонд генетический - короткий отрезок ДНК или РНК (16-30 п.н.) с известной последовательностью нуклеотидов, несущий метку (радиоактивный изотоп, флюоресцентное соединение, биотин и др.).
Изолят - малая популяция, браки в которой происходят в границах этой популяции.
Изохромосома - аномальная хромосома с удвоением одного плеча (формируются два плеча равной длины, с теми же локусами в обратной последовательности) и отсутствием второго плеча.
Иммунофлюоресцентные зонды - см. зонд генетический.
Импринтинг геномный (генный или хромосомный) - феномен различной экспрессии аллелей в зависимости от родительского происхождения.
Инбредные браки - браки между кровными родственниками II и других степеней родства.
Инверсия - тип хромосомной мутации, при которой последовательность генов в участке хромосом изменена на обратную; тип генной мутации, при которой в определенном участке ДНК последовательность оснований изменена на обратную.
Инсерция (или вставка) - тип генной мутации, при которой имеется вставка отрезка ДНК в структуру гена.
Интрон - сегмент ДНК в гене, не содержащий информации о структуре белкового продукта гена.
Информативная семья - семья с наследственным заболеванием, в которой имеется достаточное число больных и здоровых родственников из разных поколений (информативные мейозы), что позволяет оценивать расхождение признаков в изучаемой родословной при анализе генетического сцепления. Впервые описана Мэри Лайон.
Исследование типа «случай-контроль» - эпидемиологический метод, при котором пациентов с болезнью («случаи») сравнивают с должной группой контроля (без болезни) относительно частоты различных предполагаемых факторов риска.
Кариотип - хромосомный набор клетки или организма.
Картирование - определение локализации гена на хромосоме:
• генетическое - определение расположения изучаемого гена по отношению к другим генам в определенной хромосомной области;
• физическое - установление точной последовательности сайтов и физического расстояния между ними (исчисляемого в парах оснований) в изучаемой хромосомной области.
Кариотипирование спектральное (SKY - Spectral Karyotyping) - процедура, использующая технику FISH для различного окрашивания каждой из 24 хромосом человека.
Карта сцепления - хромосомная карта, показывающая относительные позиции генов и других ДНК-маркеров в хромосомах на основе анализа сцепления.
Килобаза - единица измерения, равная 1000 парам оснований
ДНК или РНК.
Клетки половые - линия клеток, из которой происходят гаметы. Клетки стволовые - клетки, способные к самовоспроизводству, пролиферации и дифференцировке; имеются почти во всех органах. Клон - генетически однородное потомство одной клетки.
Клонирование гена - встраивание определенного участка ДНК в генетическую конструкцию, например, плазмиду, с целью получения большого числа копий данного фрагмента путем введения в микроорганизмы.
Кодоминантные аллели - аллели, каждый из которых проявляется в гетерозиготе (например, группа крови по системе АВ0).
Кодон - элементарная единица генетического кода, состоящая из трех рядом находящихся оснований, сочетание которых кодирует включение специфического аминокислотного остатка в полипептидную цепь, либо сигнал начала или завершения транскрипции.
Коммитирование (детерминация) - приобретение клеткой структурно-функциональных признаков терминальной стадии дифференцировки.
Компаунд-гетерозиготность - состояние организма, при котором один и тот же локус на гомологичных хромосомах представлен разными мутантными аллелями.
Комплементарная ДНК (кДНК) - последовательность ДНК, полученная с помощью обратной транскриптазы с информационной РНК.
Комплементарность - способность нуклеотидов образовывать пары по правилу А-Т, С-G в результате формирования водородных связей между ними в двухцепочечной молекуле ДНК или в гибридной молекуле ДНК/ РНК.
Конкордантность - понятие, описывающее пару родственников, каждый из которых имеет определенный качественный признак или сходные величины количественного признака.
Консультирование генетическое - обеспечение информации и помощи больному или членам его семьи о риске заболевания, его последствиях, вероятности передачи и путях предохранения или помощи.
Кордоцентез - процедура взятия крови из пупочной вены плода.
Корреляция - статистический метод оценки связи между парными измерениями. Когда большему значению показателя в первом измерении соответствует большее значение во втором - это положительная корреляция. Отрицательная корреляция - чем больше первое значение, тем меньше второе.
Коэффициент инбридинга - вероятность того, что у одного индивида два аллеля в данном локусе происходят от одного предка.
Коэффициент корреляции (r) - мера корреляции, изменяющаяся от 1 для полной положительной связи до -1 для полной отрицательной
связи. Когда между парами измерений взаимосвязи нет, коэффициент корреляции равен нулю.
Кровнородственный - происходящий от общего предка.
Кроссинговер - обмен участками между гомологичными (не сестринскими!) хроматидами в процессе мейоза.
Лайонизация - инактивация одной из двух Х-хромосом в женской соматической клетке на ранних стадиях развития, благодаря которой обеспечивается сбалансированность генетического материала у индивидов мужского и женского пола. Инактивация отцовской и материнской хромосом носит случайный характер.
Леталь - мутация, вызывающая гибель клетки или особи до достижения репродуктивного возраста. Генетическая леталь - индивид, не способный к размножению.
Лизосомные болезни - группа наследственных болезней с унаследованной недостаточной продукцией лизосомных ферментов.
Локус - область локализации определенного генетического элемента на хромосоме.
Локусная гетерогенность - наличие в рамках единой нозологической формы различных генетических вариантов заболевания, вызываемых мутациями самостоятельных генов в разных хромосомных локусах.
Маркер - аллель (или признак), наследование которого прослеживается в потомстве.
Метилирование ДНК - один из способов эпигенетической регуляции, при котором происходит добавление метильного остатка в 5'-положение пиримидинового кольца цитозина в ДНК, в результате чего образуется 5'-метилцитозин.
Мейоз - два последовательных (1-е и 2-е) деления ядра зародышевой (половой) клетки при одном цикле репликации, в результате чего образуются гаплоидные клетки.
МикроРНК - класс некодирующей белок РНК, процессирующей в короткие интерферирующие РНК (siRNA), двуцепочечные РНК длиной около 22 нуклеотидов, влияющие на устойчивость мРНК или трансляцию (феномен РНК-интерференции). siRNA участвуют в регуляции генов в процессе развития и дифференцировки.
Миссенс-мутации - см. мутация.
Митохондриальное наследование - наследование признаков, передаваемых через ДНК митохондрий.
Множественные аллели - наличие в популяции (или у вида) более двух аллелей одного и того же локуса.
Мозаик - индивид, у которого есть клетки с различными хромосомными наборами.
Мозаицизм - наличие у индивида клеток с двумя и более вариантами хромосомных наборов или генных мутаций.
Мозаицизм, ограниченный плацентой - мозаицизм в препаратах, полученных из ворсин хориона или плаценты, отсутствующий у самого эмбриона или плода.
Моносомия - состояние клетки, при котором какая-либо хромосома представлена в единственном числе, а не парой гомологичных хромосом.
Морфогенез - процесс изменения формы, адгезии, перемещений и числа клеток, ведущий к формированию трехмерной структуры.
Морфогенетические варианты врожденные (микроаномалии развития, признаки или стигмы дисэмбриогенеза) - отклонения в развитии, выходящие за пределы нормальных вариаций, но не нарушающие функции органа.
Мультифакториальные (многофакторные) болезни - болезни, которые развиваются в результате взаимодействия определенных комбинаций аллелей разных локусов и специфических воздействий факторов окружающей среды.
Мутаген - агент, вызывающий изменения в ДНК или хромосомах и увеличивающий частоту спонтанных мутаций.
Мутант - организм, несущий мутантный аллель.
Мутация - изменение в наследственных структурах (ДНК, ген, хромосома, геном):
• генная - изменение последовательности нуклеотидов в определенном участке молекулы ДНК;
• геномная - изменение числа хромосом (кратное гаплоидному - полиплоидия, некратное - анеуплоидия);
• динамическая - мутация по типу экспансии тандемных тринуклеотидных повторов;
• мажорная - встречающаяся с высокой частотой в определенной популяции;
• миссенс - замена нуклеотида, сопровождающаяся изменением аминокислотного шифра кодона и ведущая к замене аминокислоты в составе белка;
• нейтральная (молчащая) - не сопровождающаяся изменением фенотипа;
• нонсенс - замена нуклеотида, приводящая к замещению, кодирующего аминокислоту, на стоп-кодон и сопровождающаяся преждевременным обрывом трансляции;
• нулевая - приводящая к отсутствию синтеза либо утрате функции белка;
• регуляторная - затрагивающая регуляторные последовательности гена и нарушающая его экспрессию;
• со сдвигом рамки - приводящая к нарушению нормального отсчета кодирующих триплетов (делеции или вставки участков молекулы ДНК, размеры которых некратны трем основаниям); обычно приводит к изменению аминокислотной последовательности белка;
• сплайсинговая - затрагивающая сайт сплайсинга и приводящая к неправильному вырезанию интрона либо к удалению из молекулы РНК информационно значимой экзонной последовательности;
• структурная - приводящая к протяженному (мультинуклеотидному) дефекту гена;
• точковая (точечная) - затрагивающая один нуклеотид либо 1-2 соседних нуклеотида;
• хромосомная - любое нарушение структуры хромосом (делеция, дупликация, инверсия, транслокация).
Наследование комплексное (многофакторное) - неменделирующий тип наследования. Признаки с комплексным наследованием обычно вызваны аллелями более чем одного локуса, взаимодействующими с влиянием факторов окружающей среды.
Наследование материнское - передача генетической информации только через мать.
Наследственная болезнь - болезнь, для которой этиологическим фактором является генная, хромосомная или геномная мутация.
Наследуемость (h2) - часть общей фенотипической изменчивости количественного признака, обусловленная генетическими факторами.
Неполно доминантный (синоним полудоминантный) - признак, наследующийся по доминантному типу, но более тяжело проявляющийся у гомозигот, чем у гетерозигот.
Неравновесное сцепление - неслучайное распределение частот аллелей генетических маркеров в исследуемой группе лиц по сравнению с общей популяцией.
Нерасхождение - неправильное разделение двух хромосом одной пары в ходе мейоза I или двух хроматид хромосомы в тече-
ние мейоза II или митозе, что приводит к тому, что оба гомолога передаются в одну дочернюю клетку, тогда как в другую не передается ничего.
Нозерн-блоттинг - техника, аналогичная блоттингу по Саузерну, позволяющая обнаружить молекулы РНК-гибридизацией с комплементарным ДНК-зондом.
Нонсенс-мутации - см. Мутация.
Норма реакции - границы выраженности фенотипов при одном и том же генотипе в различных условиях среды.
Носитель - индивид, имеющий одну копию гена, который обусловливает рецессивную болезнь, и одну копию нормального аллеля.
Нуклеотид - молекула, состоящая из азотистого основания, 5-углеродного сахара и фосфатной группы. Нуклеиновая кислота - полимер множества нуклеотидов.
Обмен хроматидный сестринский - обмен сегментами ДНК между сестринскими хроматидами.
Обратная транскриптаза - фермент, осуществляющий перевод молекулы РНК в молекулу кДНК (обратная транскрипция).
Ограниченный полом - признак, который проявляется только у одного пола, хотя ген, определяющий признак, не сцеплен с Х-хромосомой.
Однонуклеотидный полиморфизм (SNP) - варианты последовательностей ДНК у разных людей, отличающиеся по одной паре оснований и встречающиеся в популяции с частотой более 1%. Варианты, встречающиеся менее чем у 1% популяции относят к мутациям.
Олигонуклеотид - короткая однонитевая молекула ДНК или РНК (приблизительно 16 -30 нуклеотидов).
Онкоген - доминантный ген, повышение экспрессии которого играет важную роль в развитии опухолей.
Ортологичный - ген другого биологического вида, имеющий аналогичную последовательность ДНК и кодирующий белки с той же функцией. Ортологичные гены происходят от общего предка.
Отбор - действие сил, определяющих относительную приспособленность генотипа в популяции, таким образом влияющих на частоту интересующего гена.
Отношение шансов - сравнение шансов того, что индивиды, имеющие конкретный фактор (например, генотип, влияние окружаю-
щей среды или лекарства), будут иметь болезнь или признак, против таких же шансов для индивидов, у которых нет этого фактора.
Панмиксия - случайный подбор лиц, вступающих в брак, в пределах всей популяции.
Паралогичный - относится к двум или более генам одного биологического вида, имеющим аналогичные последовательности ДНК и, вероятно, кодирующие белки с аналогичными, возможно перекрывающимися, но не идентичными функциями. Паралогичные гены, вероятно, происходят от общего гена-предшественника. Например, гены α- и β-глобина.
Пенетрантность - частота проявления фенотипа (признака или болезни), детерминируемого доминантным аллелем или рецессивным аллелем в гомозиготном состоянии.
Пероксисомные болезни - наследственные болезни обмена веществ, обусловленные нарушением биогенеза или функции пероксисом.
Плазмиды - самостоятельно копирующиеся внехромосомные циклические молекулы ДНК у бактерий и дрожжей; используются в молекулярной биологии в качестве векторов для клонирования сегментов ДНК.
Плейотропность - влияние одного гена на развитие двух или более фенотипических признаков.
Плюрипотентный - характеристика эмбриональной клетки, способной создавать различные типы тканей или структур в зависимости от положения и влияния окружающей среды.
Повторы тандемные - две или больше копий одинаковой (или аналогичной) последовательности ДНК, располагающиеся последовательно вдоль хромосомы.
Полигенные признаки - признаки, обусловленные многими генами в различных локусах, каждый из которых оказывает лишь небольшое влияние на степень экспрессии данного признака.
Полимеразная цепная реакция (ПЦР) - метод циклического синтеза in vitro огромного числа копий определенного участка ДНК длиной от десятков до нескольких тысяч пар оснований:
• количественная - реакция, по результатам которой оценивается количественный выход продуктов амплификации с помощью соответствующих сканирующих устройств;
• мультиплексная (мультипраймерная) - одновременная амплификация в одной реакции нескольких участков исследуемого гена;
• обратнотранскриптазная - реакция, в которой матрицей служат молекулы кДНК.
Полиморфизм - наличие в популяции двух или более альтернативных генотипов с частотой, превышающей поддерживаемую только за счет повторных мутаций. Условно считается, что локус полиморфный, если редкий аллель имеет частоту 0,01, что дает частоту гетерозигот по крайней мере 0,02. Любой аллель, встречаемый реже, считается редким вариантом.
Полиморфизм однонуклеотидный - полиморфизм в последовательности ДНК, состоящий из изменений в одном основании.
Полиморфизм сбалансированный - полиморфизм, поддерживаемый в популяции преимуществом гетерозигот, позволяя даже опасному в гомозиготном состоянии аллелю персистировать в популяции со сравнительно высокой частотой.
Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) - вариабельность длин фрагментов ДНК, полученных при действии поределенной рестриктазы на разные образцы ДНК. Отражает отличия в нуклеотидном составе участков ДНК, узнаваемых данной рестриктазой.
Полиморфизм коротких тандемных повторов (STRP - Short Tandem Repeat Polymorphysm) - полиморфный локус, состоящий из варьирующего числа последовательно расположенных повторяющихся блоков динуклеотидов, тринуклеотидов и тетрануклеотидов.
Полиплоид - клетка (ткань или организм), имеющая 3 хромосомных набора или более.
Половые хромосомы - хромосомы, определяющие пол индивида (у человека Х- и Y-хромосомы).
Последовательность фланкирующая - область, предшествующая гену или следующему транскрибируемому участку.
Потеря гетерозиготности - возникновение мутации или делеции в соматической клетке в том локусе гомологичной хромосомы, по которому организм гетерозиготен. Типично для многих случаев ретинобластомы, рака молочной железы и других опухолей, вызванных мутациями в генах-супрессорах опухолевого роста.
Поток генов - постепенное проникновение генов из одной популяции в другую через барьер. Барьер может быть физическим или культурным и может нарушаться миграцией или смешиванием.
Праймер - олигонуклеотид, выполняющий роль «затравки» и инициирующий синтез полинуклеотидной цепи на ДНКили РНКматрице.
Предрасположенность генетическая - комбинация аллелей разных локусов, предрасполагающих к более раннему возникновению заболеваний под влиянием факторов окружающей среды и более тяжелому их течению.
Пренатальная диагностика - диагностика наследственных болезней или других нарушений в период внутриутробного развития.
Пробанд - лицо, с которого начинается сбор родословной.
Прогностическое (предсказательное) ДНК-тестирование - проведение ДНК-анализа у клинически здорового человека с целью установить его генетический статус, который может привести к развитию наследственной болезни или болезни с наследственной предрасположенностью.
Промотор - регуляторный участок гена, с которым связывается РНК-полимераза перед началом транскрипции.
Просеивание - см. Скрининг.
Протеом - полный набор белков, кодируемых геномом.
Протоонкоген - нормальный ген, участвующий в отдельных аспектах деления или пролиферации клеток, способный вследствие мутаций или других механизмов становиться онкогеном.
Процессинг РНК (созревание РНК) - процесс превращения первичного РНК-транскрипта в молекулу зрелой мРНК путем удаления интронов и полиаденилирования.
Псевдоген - участок ДНК, очень сходный по последовательности оснований с известным геном, но не выполняющий такую функцию либо из-за потери сигнализации трансляции (промоторной последовательности), либо несущий мутацию, которая предотвращает трансляцию.
Пул генов - все аллели, представленные в данном локусе или, более широко, во всех локусах популяции.
Регуляторный участок гена - сегмент ДНК (промотор, энхансер или регуляторный регион локуса внутри или около гена), регулирующий экспрессию данного гена.
Рекомбинантная ДНК - молекула ДНК, «собранная» в пробирке с использованием сегментов ДНК из различных организмов.
Рекомбинация - образование новых комбинаций аллелей в связи с кроссинговером между локусами.
Ренатурация - см. гибридизация.
Репарация - исправление повреждений в молекуле ДНК и восстановление ее нативной первичной структуры.
Рестриктаза (рестрикционная эндонуклеаза) - фермент бакте-
риального происхождения, распознающий специфическую нуклеотидную последовательность длиной от 4 до 10 пар оснований и разрезающий двунитевую молекулу ДНК в этом месте.
Рестрикционный анализ - метод анализа ДНК с использованием рестрикционных эндонуклеаз.
Ретровирусы - вирусы с геномом, состоящим из РНК, размножающиеся преобразованием РНК в ДНК, благодаря ферменту обратной транскриптазе.
Рецессивность - свойство соответствующего аллеля проявляться в виде признака только в гомозиготном состоянии.
Рибосома - цитоплазматическая органелла, состоящая из рибосомной РНК и белка, синтезирующая полипептиды на основе мРНК.
Риск - вероятность появления события. Часто вычисляется как число случаев появления конкретного события, разделенное на число всех возможных событий. Как и все вероятности, риск изменяется от 0 до 1.
Риск эмпирический - вероятность того, что признак будет наблюдаться у члена семьи, основанная не на знании причин болезни, а на наблюдаемых частотах больных и здоровых лиц в семейных исследованиях.
РНК-полимераза - фермент, осуществляющий синтез РНК на ДНК-матрице.
Родословная - схема, показывающая родство между членами одной семьи в ряду поколений.
Сайт - определенное место (позиция) в молекуле ДНК:
рестрикции - специфическая нуклеотидная последовательность длиной 4-10 п.н., распознаваемая рестриктазой;
сплайсинга - специфическая нуклеотидная последовательность на границе между экзоном и интроном, играющая сигнальную роль для правильного протекания сплайсинга.
Сайт рестрикции - короткая последовательность ДНК, распознаваемая и разрезаемая специфической эндонуклеазой (рестриктазой).
Сантиморганида (сМ) - единица генетического расстояния между локусами; 1 сМ соответствует частоте рекомбинационных событий между локусами в 1% случаев (эквивалентна в среднем примерно 1 млн. пар оснований).
Сегрегация - расхождение гомологичных хромосом в мейозе.
Секвенирование - определение последовательности нуклеотидов в молекуле ДНК или последовательности аминокислот в молекуле белка.
Семейные болезни - болезни, наблюдающиеся у нескольких членов семьи в одном или нескольких поколениях. Сибство - все сибсы в семье.
Сибсы - родные братья и сестры (от англ. Sisters - Brothers).
Синдром - характерный набор аномалий, предположительно вызванный одной причиной.
Синдром протяженной делеции - синдром, вызванный микроделецией хромосомной ДНК, захватывающий два или более последовательно расположенных локуса (син. сегментная анеусомия).
Синтения - физическое присутствие в одной хромосоме двух или более локусов генов, независимо от того, достаточно ли они близки друг к другу, чтобы иметь сцепление.
Скрещивание ассортативное - выбор супруга с предпочтением конкретного генотипа, то есть неслучайное скрещивание.
Скрининг (просеивание) - обследование больших групп людей на какие-либо состояния (болезни или носительство) с целью активной профилактики болезней; выявление не диагностированной ранее болезни с помощью простых методов, дающих быстрый ответ.
Сплайсинг - процесс удаления интронов и объединения экзонов в зрелую мРНК.
Спорадический - случай болезни, не являющийся результатом наследования патологического аллеля от больного родителя, т.е. результат новой половой или соматической мутации.
Стоп-кодон - нуклеотидный триплет, являющийся сигналом окончания трансляции.
Сцепление генов - совместная передача генов (признаков) с вероятностью, превышающей случайную.
Тандемные повторы - множественные и расположенные друг за другом копии определенной последовательности ДНК, число которых варьирует у разных индивидов (варьирующее число тандемных повторов - от англ. VNTR):
• динуклеотидные - из 2 нуклеотидов (обычно СА); используются в качестве генетических маркеров;
• тринуклеотидные - из 3 нуклеотидов; увеличение их числа (экспансия) приводит к наследственным болезням нервной системы (динамические мутации).
Теломера - конец плеча хромосомы. У человека теломеры оканчиваются тандемными копиями последовательности (TTAGGG)n, необходимой для правильно репликации концов хромосом.
Теломераза - обратная транскриптаза рибонуклеопротеинов, использует свой собственный шаблон РНК, чтобы добавлять в теломеру видоспецифические гексамеры (например, TTAGGG у человека).
Тельца Барра - половой хроматин. Представляет неактивную Х-хромосому.
Терапия генная - способ лечения путем введения дополнительной генетической информации в клетки индивида на уровне ДНК или РНК (генно-инженерных конструкций) или путем изменения экспрессии генов.
Тератоген - агент, вызывающий врожденные пороки развития или увеличивающий их встречаемость.
Технология рекомбинантной ДНК - методы создания молекулы ДНК in vitro из сегментов более чем одной родительской молекулы
ДНК.
Трансверсия - мутация, вызванная заменой пуринового основания на пиримидиновое или наоборот.
Трансген - ген, переносимый в клетку при генной терапии в составе вектора.
Трансгенные организмы - животные, растения, микроорганизмы, вирусы, генетическая программа которых изменена с помощью методов генной инженерии.
Трансгеноз - процедура (или процесс) передачи дополнительной чужеродной генетической информации в организм, клетку.
Трансдукция - введение в клетку гена и как следствие изменение ее генома.
Транскриптаза обратная - фермент, РНК-зависимая ДНКполимераза, катализирует синтез ДНК по шаблону РНК.
Транскрипционный фактор - белок, связывающийся с регуляторной областью гена и регулирующий его экспрессию.
Транскрипция - считывание наследственной информации при эксп рессии гена.
Транслокация - хромосомная мутация. Перенос сегмента одной хромосомы на другую.
Транслокация робертсоновская - транслокация между двумя акроцентрическими хромосомами со слиянием их в центромере с утратой коротких плеч.
Трансляция - передача наследственной информации; синтез белковой молекулы или перевод последовательности оснований мРНК в последовательность аминокислот в полипептидной цепи.
Транспозон - один из классов мобильных элементов генома; транспозон может перемещаться внутри генома («прыгающий участок ДНК»).
Триплоидный - клетка с тремя копиями каждой хромосомы или индивид, состоящий из таких клеток.
Трисомия - добавочная хромосома в кариотипе диплоидного организма; вид полисомии, при котором имеются 3 гомологичные хромосомы (индивид с трисомией называется трисомиком).
Фармакогенетика - раздел медицинской биохимической генетики, изучающий роль наследственности в реакциях организма на лекарства.
Фармакогеномика - создание новых типов лекарств на основе геномной информации; предсказание возможных ответов организма на лекарства на основе анализа генома.
Фенокопия - клинический синдром, сходный по проявлениям с наследственным заболеванием, но имеющий негенетическую природу.
Фенотип - признаки, проявляющиеся в результате действия генов в определенных условиях среды.
Ферментопатия - метаболическое заболевание, вызванное недостаточностью или аномалией конкретного фермента.
Фетоскопия - процедура, позволяющая визуально обследовать плод в матке при помощи волоконно-оптической техники.
Фетотерапия (плодная терапия, пренатальная терапия) - лечение плода до рождения.
Химера - индивид, содержащий клетки, производные от двух генетически разных зигот.
Хромосомная мутация (аберрация) - изменение в структуре хромосо мы.
Хромосомный набор - совокупность хромосом в ядре гаметы, зиготы или соматической клетки.
Хромосомы бактериальные искусственные (BACs - Bacterial Artificial Chromosomes) - векторы, способные нести 100-130 килобаз клонированной ДНК человека. Размножаются в бактериях и используются для картирования генов высокого разрешения и секвенирования ДНК.
Х-сцепленное наследование - тип наследования признаков, гены которых локализованы в Х-хромосоме.
Центромера - первичная перетяжка в хромосоме, место соединения сестринских хроматид и формирования кинетохор. Необходима для нормального расхождения в митозе и мейозе.
Центросомы - два центра, организующих рост микротрубочек митотического веретена; видны на полюсах делящейся клетки в конце профазы.
Цис-положение - обозначает положение между двумя последовательностями в одной хромосоме, буквально «с одной стороны». Противоположно транс-положению.
Экзон - отдельный фрагмент прерывистого гена, сохраняющийся в зрелой РНК после удаления интронных фрагментов.
Экспансия тринуклеотидных повторов - патологическое увеличение числа копий внутригенных тандемных последовательностей, состоящих из 3-х нуклеотидов; этот тип мутаций называют также динамическими мутациями.
Экспрессивность - степень фенотипической выраженности (проявления) генетически детерминируемого признака.
Экспрессируемая короткая последовательность (от англ. expressed sequence tag - EST) - короткая последовательность (100-500 п.н.) обычно из одного конца клонированной ДНК; используется для идентификации генов, альтернативного сплайсинга и распределения транскриптов в тканях.
Экспрессия гена - активизация транскрипции гена, в процессе которой на смысловой нити ДНК синтезируется мРНК.
Электропорация - один из методов переноса чужеродной ДНК в клетки основанный на пермеабилизации клеточной мембраны под действием электрического поля.
Эндонуклеаза рестрикционная (рестриктаза) - фермент, получаемый из бактерий, способный распознавать специфическую последовательность ДНК и расщеплять молекуля ДНК в области сайта распознавания или рядом с ним.
Энхансер - короткий регуляторный сегмент ДНК, который влияет на уровень экспрессии примыкающих к нему генов, увеличивая частоту инициации транскрипции.
Эпигенетический - термин, обозначающий любой фактор, влияющий на функцию гена без изменения генотипа. К эпигенетическим факторам относятся изменения в метилировании ДНК, структуре хроматина, модификация гистонов.
Эписома - элемент ДНК, способный существовать как автономная копируемая последовательность в цитоплазме или внедренная в хромосомную ДНК.
Эуплоидия - наличие у индивида полных наборов хромосом.
Эухроматин - богатые генами участки хромосом; слабо красится при G-окраске, конденсируясь и становясь прозрачным в интерфазе.
Эффект основателя (родоначальника) - высокая частота идентичных аллелей как результат наследования от единого предка.
Эффект положения (гена) - изменение экспрессии гена при его переносе из нормального хромосомного окружения в новое (например, в область гетерохроматина).
ПРИЗНАКИ ДИСМОРФОГЕНЕЗА
Агенезия (аплазия) - полное врожденное отсутствие органа или его части.
Акромикрия - непропорционально маленькие кисти и стопы.
Акроцефалия («башенный» череп) - череп с высоким лбом, сглаженными надбровными и височными выступами вследствие преждевременного закрытия венечного и затылочного швов.
Алопеция - полное или частичное отсутствие волос на голове.
Аниридия - отсутствие радужной оболочки.
Анодонтия - отсутствие постоянных зубов.
Анонихия - врожденное отсутствие любого числа ногтей.
Анофтальмия - врожденное отсутствие глазного яблока.
Антимонголоидный разрез глаз - наружные углы глаз располагаются ниже внутренних.
Арахнодактилия (паукообразные пальцы) - узкая длинная ладонь с длинными пальцами.
Артрогрипоз - множественные врожденные контрактуры суставов.
Ателия - отсутствие сосков.
Атрезия - полное отсутствие канала или естественного отверстия. Афакия - отсутствие хрусталика. Блефарофимоз - короткая и узкая глазная щель. Брахидактилия - укорочение пальцев рук или ног. Витилиго - очаговая депигментация кожи. Вормиевы косточки - вставочные косточки в черепе. Гетерохромия радужки - неодинаковый цвет различных участков радужки.
Гиперодонтия - наличие сверхкомплектных зубов. Гипертелоризм - широко расставленные глаза (оценивается по межорбитальному индексу: в числителе - расстояние между орбита-
ми в сантиметрах, умноженное на 100; в знаменателе - окружность головы в сантиметрах. При гипертелоризме межорбитальный индекс более 6,8).
Гипертрихоз - замена пушковых волос грубыми пигментированными волосами.
Гиподонтия - уменьшенное число зубов по сравнению с возрастной нормой.
Гипоплазия - недоразвитие органа, проявляющееся дефицитом относительной массы или размера.
Гипоспадия - нижняя расщелина уретры со смещением наружного отверстия мочеиспускательного канала.
Гипотелоризм - близко расположенные глаза; межорбитальный индекс менее 3,8 (см. Гипертелоризм).
Гипотрихоз - редкие волосы вследствие недостаточного их роста.
Гирсутизм - чрезмерное оволосение по мужскому типу у женщин.
Диастема - промежуток между верхними или нижними центральными резцами 3 мм и более.
Дискория («кошачий глаз») - щелевидный зрачок.
Дистихиаз - двойной ряд ресниц.
Долихостеномелия - длинные тонкие конечности.
Изодактилия - примерно равная длина II, III, IV и V пальцев.
Камптодактилия - сгибательная контрактура в межфаланговых суставах пальцев кисти.
«Карпий рот» - рот с опущенными углами рта и дугообразной верхней губой.
Клинодактилия - латеральное или медиальное искривление пальца.
Клювовидный нос - нос в виде птичьего клюва.
Колобома радужки - щелевидный дефект радужной оболочки глаза.
Конская стопа (pes equinus) - контрактура голеностопного сустава, при которой стопа фиксирована в положении чрезмерного подошвенного сгибания.
Короткий мизинец (симптом Дюбуа) - конец мизинца не достигает складки концевой фаланги IV пальца.
Краниостеноз - уменьшение объема черепа с задержкой развития головного мозга вследствие преждевременного закрытия швов.
Крипторхизм - отсутствие одного или обоих яичек в мошонке, обусловленное задержкой их внутриутробного перемещения из забрюшинного пространства. Яички могут располагаться в паховом канале или в брюшной полости.
Крыловидные складки (птеригии) - вертикальные кожные складки на боковых поверхностях шеи.
Лагофтальм - неполное смыкание век. Макроглоссия - увеличенный язык. Макроорхизм - увеличенные яички.
Макросомия - чрезмерно увеличенные размеры и масса тела. Макростомия - чрезмерно широкая ротовая щель. Макротия - увеличенные ушные раковины. Макрофаллос - увеличенный половой член.
Макроцефалия - череп, увеличенный более чем на 10% возрастной нормы.
Микрогения - уменьшенная нижняя челюсть.
Микроглоссия - уменьшенный язык.
Микрогнатия - уменьшенная верхняя челюсть.
Микромелия - укороченные конечности, имеющие все сегменты.
Микроорхизм - уменьшенные яички.
Микросомия - чрезмерно уменьшенные размеры и масса тела.
Микростомия - уменьшенная ротовая щель.
Микротия - уменьшенные размеры ушной раковины.
Микрофаллос - уменьшенный половой член.
Микрофтальмия - уменьшенные размеры глазного яблока.
Микроцефалия - череп, уменьшенный более чем на 10% по сравнению с возрастной нормой.
Монголоидный разрез глаз - наружные углы глаз располагаются выше внутренних.
«Мыс вдовы» - клиновидный рост волос на лбу.
Оксицефалия - асимметричная акроцефалия (см.) или смещение «башни» черепа в одну сторону.
Олигодактилия - уменьшение числа пальцев на кистях или стопах.
Палатосхиз - расщелина нёба.
«Папиросные» рубцы - рубцы, напоминающие папиросную бумагу. Пахионихия - утолщение ногтей.
Пилонидальная ямка (сакральный синус) - слепо заканчивающийся канал в межъягодичной складке у копчика.
Плагиоцефалия - асимметрия правой и левой сторон черепа.
Платицефалия - череп с плоским сводом.
Полая стопа (pes excavatus) - чрезмерно высокий свод стопы.
Полидактилия постаксиальная - дополнительные пальцы со стороны V пальца кисти или стопы.
Полидактилия преаксиальная - дополнительные пальцы со стороны I пальца кисти или стопы.
Полителия - избыточное число сосков.
Поперечная ладонная складка («обезьянья» складка) - поперечная борозда, идущая через всю ладонь.
Преаурикулярные папилломы - доброкачественные опухоли в виде сосочков впереди ушной раковины.
Преаурикулярные фистулы (ямки) - слепо оканчивающиеся ходы перед ушной раковиной (рудимент I жаберной дуги).
Прогения - выступающая нижняя челюсть.
Прогнатия - выдвинутая вперед верхняя челюсть.
Птоз - опущение века или внутренних органов.
Пяточная стопа (pes calcaneus, выступающая пятка) - контрактура голеностопного сустава с фиксацией стопы в положении разгибания.
Расщелина позвоночника (spina bifida) - неполное закрытие позвоноч ного канала.
Ретрогнатия - смещение верхней челюсти назад.
Сандалевидная щель - большой промежуток между I и II пальцами стопы.
Седловидный нос - впадина в средней части спинки носа с выступающими вперед ноздрями из-за недоразвития костной части носовой перегородки.
Синдактилия кожная или костная - частичное или тотальное сращение пальцев.
Синофриз - рост бровей над переносьем, создающий объединенную линию бровей (слившиеся или сросшиеся брови).
Скафоцефалия (ладьеобразный череп) - удлиненный череп с выступающим гребнем на месте преждевременно закрытого сагиттального шва.
Стопа-качалка - стопа с плосковыпуклой подошвенной поверхностью и выступающей кзади пяткой.
Стрии - линейные полоски истонченной кожи.
Телекант - латеральное смещение внутренних углов глазных щелей при нормально расположенных орбитах и глазных яблоках.
Тригоноцефалия - расширение черепа в затылочной и сужение в лоб ной части.
Тристихиаз - тройной ряд ресниц.
Уздечка языка короткая - укорочение или прикрепление уздечки в области кончика языка, приводящее к ограничению его подвижности.
Фильтр - расстояние от нижней точки носовой перегородки до красной каймы верхней губы.
Череп в форме трилистника - высокий выбухающий лоб, плоский затылок, выпячивание височных костей с вдавлением в местах их соединения с теменными костями.
Шалевидная мошонка - мошонка, окружающая валиком спинку поло вого члена.
Экзофтальм - смещение глазного яблока вперед с расширением глазной щели.
Эктродактилия - клешневидные кисти или стопы из-за отсутствия одного или нескольких пальцев.
Энофтальм - смещение глазного яблока назад; более глубокое, чем в норме, расположение глазного яблока в глазнице.
Эпикант - вертикальная кожная складка, прикрывающая внутренний угол глазной щели.
Эписпадия - верхняя расщелина уретры.